Владислав Шапша назначил его министром здравоохранения
В должности и.о. Пахоменко пробыл совсем недолго - очевидно, он за короткий срок доказал способность управлять всей областной медициной. К тому же он и до этого был хорошо знаком губернатору. Пахоменко дважды избирался депутатом Горсобрания, был председателем бюджетного комитета, заведовал поликлиникой МРНЦ. В ранге и.о. министра он проработал всего полтора месяца.
На посту министра он сменил Алана Цкаева, который ушел с этой должности, написав заявление по собственному желанию, - министром проработал около года, Шапша назначил его на этот пост в первую волну пандемии. Однако уход Цкаева сопровождался большим скандалом. Он случился после того, как прокуратура направила в правительство региона представление, в котором обозначила нарушения - Цкаеву, когда он был еще главврачом БСМП, по его личной просьбе выписана премия более чем в 9 млн руб. Прокуратура сочла это незаконным. Недавно она обратилась в суд с иском к Алану Цкаеву с требованием взыскать незаконно полученную сумму в бюджет.