В его трудовой книжке — всего несколько записей, но место работы одно: Физико-энергетический институт. Он приехал в Обнинск в 1959 году и погрузился в исследования по быстрым реакторам. Быстро дорос до заместителя руководителя натриевой лаборатории, где занимался вопросами очистки натриевого теплоносителя, а позже принимал непосредственное участие в пусконаладке реакторов на быстрых нейтронах БН-350 и БН-600. Внес большой вклад в обеспечение безопасности атомных установок. Созданный им индикатор водорода в натрии до сих пор используется при контроле герметичности парогенераторов.

В 80-х перешел на организационную работу, став заместителем директора теплофизического отделения, где на тот момент трудилось более 400 человек. Эрнест Кузнецов отвечал за экспериментальную базу, ее безаварийную эксплуатацию, координировал работу исследовательских подразделений. Но главное внимание в своей работе всегда уделял людям. Те времена и для страны, и особенно для атомной науки были очень тяжелыми, и Эрнест Константинович не просто всегда находил слова, чтобы поддержать сотрудников, но умел помочь делом, решая их проблемы. При этом всегда сохранял бодрость духа, заражал окружающих энергией и позитивом, а его спокойная и доброжелательная манера общения и способность находить выход в самых сложных условиях заслужили не только авторитет в коллективе, но и любовь коллег.

Все, кто хоть раз сталкивался с Эрнестом Константиновичем в производственной, общественной или личной жизни, говорят о нем, как о человеке большого сердца и широкой души. Память о нем навсегда останется в их сердцах.